生物序列专利检索是一种独特的生命科学检索类型，需要专业工具和行业知识。在我们之前的网络研讨会中，Questel 的 Juliane Wissuwa 讨论了有效的生物序列专利检索技术以及选择专业搜索工具的好处。在这里，我们总结了她演讲中的要点。
生物序列（或生物序列）是单个连续的核酸或氨基酸分子，形成 DNA/RNA 或蛋白质，并携带生物体发育、功能、生长和繁殖的指令。
生物序列包含酶、抗体、激素、抑制剂分子或基因改造定位分子（CRISPR/Cas）的信息。它们被各个行业和学术部门视为专利，包括制药行业、生物技术、农用化学品、食品和酶行业，以及技术转让办公室 (TTO) 和研发 (R&D) 机构。
这些专利不仅涵盖生物制剂、疫苗和药物等药物相关发明，还涵盖诊断和生物催化剂（生物技术）、发酵、转基因作物、植物和动物育种（农业）以及调味或增强分子（食品）方面的创新。
然而，不存在“标准”的生物序列专利，因为字符串的长度各不相同，从几个残基到几百万个残基，并且专利可能只捕获一小部分或整个基因组。
生物序列专利检索的独特挑战
虽然生物序列以连续的字母序列表示（如上图所示），但在专利权利要求中很少以此类推。大多数情况下，它们以编号或表格形式显示（如下图顶部所示），或在附件中以表格或附件形式引用。
此外，专利可能引用整个生物序列或子序列，如下例所示，其中引用了特定的氨基酸残基：
最后，专利可以要求生物序列或仅仅为了提供信息而披露它。
如何在Orbit Intelligence上进行生物序列专利搜索
Orbit BioSequence是一款专门用于比较序列相似度的工具。如下所示，它使用户能够以 FASTA 格式搜索生物序列，无论是核酸还是氨基酸；在多次搜索中使用相同的序列类型；并根据特定的生物序列调整搜索参数，包括：
- 查询长度：长/短/动机；
- 合适的数据库：核苷酸或蛋白质数据库或两者，以获得最详尽的结果；
- 主题序列长度：限制长度以寻找短序列作为引物（因为您可能不需要搜索整个基因组信息）。
如果您只收到有限数量的结果，您可以手动查看它们。但是，许多生物序列专利搜索将带来数百甚至数千个结果，因此Orbit BioSequence包含专业过滤器，以帮助消除噪音并缩小或集中结果。
- 生物序列过滤器使您能够根据查询或主题的匹配百分比、错误或间隙的数量以及主题或对齐长度进行过滤，以及将搜索限制在权利要求范围内，以便仅显示权利要求（而不是引用）该序列的专利。
- 专利过滤器有助于通知自由实施搜索，方式如下： 使您能够按法律状态、申请年份和出版国家进行筛选。这确保您不必在全球范围内搜索即可找到相同或相似的序列。
- 相关性过滤器使您能够通过关键字（语义）、国际专利分类 (IPC) 编号和受让人进行搜索，甚至提取涉及诉讼、异议、许可等的专利。
- 高级搜索选项使您能够将生物序列搜索与关键字搜索结合起来，以减少噪音，而不会丢失宝贵的生物序列信息。
