생물 시퀀스 특허 검색 가이드

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overview

바이오 시퀀스 특허 검색은 전문 도구와 산업 지식이 필요한 독특한 유형의 생명 과학 검색입니다. 이전 웨비나 에서 Questel의 Juliane Wissuwa는 생물학적 시퀀스에 대한 효과적인 특허 검색 기술과 전문 검색 도구를 선택하는 이점에 대해 논의했습니다. 여기에서 그녀의 프레젠테이션의 핵심 요점을 요약합니다.

생물학적 서열(또는 바이오 서열)은 핵산이나 아미노산의 단일하고 연속적인 분자로, DNA/RNA 또는 단백질을 형성하고 생물체의 발달, 기능, 성장 및 번식에 대한 지침을 전달합니다.

바이오 시퀀스에는 효소, 항체, 호르몬, 저해제 분자 또는 유전자 변형을 위한 위치 분자(CRISPR/Cas)에 대한 정보가 들어 있습니다. 이는 제약 산업, 바이오테크, 농화학, 식품 및 효소 분야를 포함한 다양한 산업 및 학술 분야와 기술 이전 사무소(TTO) 및 연구 개발(R&D) 기관에서 특허로 수집됩니다.

생물서열 특허검색, DNA 문자열의 예 — *DNA 서열(위)과 단백질로 번역된 서열(아래)의 예시 생물학적 서열 문자열입니다.*

이러한 특허는 생물학 제제, 백신, 약물과 같은 약물 관련 발명품뿐만 아니라 진단 및 생촉매(생명공학), 발효, 변형 작물, 식물 및 동물 육종(농업), 향미료 또는 증강제 분자(식품) 분야의 혁신도 포함합니다.

그러나 문자열의 길이가 몇 개의 잔류물에서 수백만 개에 이르기까지 다양하고 특허는 작은 단편이나 전체 게놈만을 포착할 수 있기 때문에 "표준" 바이오 시퀀스 특허는 없습니다.

생물 시퀀스 특허 검색의 고유한 과제

연속된 문자 시리즈로 포착되지만(위 그림 참조), 바이오 시퀀스는 특허 청구에서 그 자체로 표시되는 경우가 드뭅니다. 대부분 번호가 매겨지거나 표로 표시되거나(아래 위쪽 참조) 첨부 파일에서 표 또는 부록으로 참조됩니다.

생물서열 특허검색, 특허인용 예시

또한 특허는 아래 예에서 볼 수 있듯이 특정 아미노산 잔기를 참조하는 전체 생물학적 서열 또는 하위 서열을 참조할 수 있습니다.

생물 서열 특허 검색, 특허 인용 서브 시퀀스의 예

마지막으로, 특허는 생물학적 서열을 주장하거나 단순히 정보 제공을 위해 공개할 수도 있습니다.

생물 시퀀스 특허 찾다 세부 사항

"일반적인" 특허 검색은 의미론적 검색으로, 키워드와 동의어를 부울 연산자와 잘림 및/또는 와일드카드와 결합하여 검색 범위를 좁힙니다. 그러나 이러한 유형의 검색은 생물 서열 특허 검색에는 적용할 수 없습니다. 두 가지 문제가 발생하기 때문입니다.

첫째, 위에서 설명한 대로, 생물학적 서열은 특허 본문에 직접 표시되지 않고 보충 자료/부록이나 표 안에 추가되는 경우가 많습니다.
두 번째로, 바이오 시퀀스는 글자 내부에 작은 변형이 있을 수 있지만 여전히 동일한 기능을 하므로 잘림/무작위 검색을 통해 모든 변형을 예상하는 것은 어렵고 시간도 많이 걸립니다.

대신, 특정 생물학적 시퀀스 형식(FASTA)에 따라 검색하고 길이 등의 고유한 생물학적 시퀀스 매개변수에 따라 검색 매개변수를 조정할 수 있는 전담 도구가 필요합니다.

Orbit Intelligence 에서 Bio Sequence 특허 찾다 수행하는 방법

Orbit BioSequence 는 시퀀스 간의 유사성을 비교하기 위한 전용 도구입니다. 아래에 표시된 대로, 사용자는 FASTA 형식으로 생물학적 시퀀스를 핵산 또는 아미노산으로 검색할 수 있고, 여러 검색에서 동일한 시퀀스 유형을 사용하고, 다음을 포함하여 특정 생물학적 시퀀스에 따라 검색 매개변수를 조정할 수 있습니다.

질의 길이: 길다/짧다/동기;
적절한 데이터베이스: 가장 포괄적인 결과를 얻으려면 뉴클레오타이드나 단백질 데이터베이스 또는 둘 다 필요합니다.
주제 시퀀스 길이: 프라이머로서 짧은 시퀀스를 찾기 위한 길이를 제한합니다(전체 게놈 정보를 검색할 필요가 없을 수도 있음).

Orbit BioSequence에서의 바이오 시퀀스 특허 검색 예시 — *Orbit BioSequence에서의 예시 바이오 시퀀스 특허 검색 ©Questel*

제한된 수의 결과만 수신되는 경우 수동으로 검토할 수 있습니다. 그러나 많은 바이오 시퀀스 특허 검색은 수백 개 또는 수천 개의 결과를 가져오므로 Orbit BioSequence 에는 노이즈를 제거하고 결과를 좁히거나 집중시키는 데 도움이 되는 전문 필터가 포함되어 있습니다.

바이오시퀀스 필터를 사용 하면 질의나 주제의 일치율, 오류나 간격의 수, 주제나 정렬 길이에 따라 필터링할 수 있으며, 검색을 청구항으로 제한하여 시퀀스를 참조하는 것이 아니라 청구항에 해당하는 특허만 표시됩니다.
특허 필터는 다음을 통해 운영의 자유 검색을 알려줍니다. 법적 지위, 신청 연도 및 출판 국가별로 필터링할 수 있습니다. 이를 통해 동일하거나 유사한 시퀀스를 식별하기 위해 전 세계를 검색할 필요가 없습니다.
관련성 필터를 사용하면 키워드(의미론), 국제 특허 분류(IPC) 번호, 양수인으로 검색하거나 소송, 이의, 라이선싱 등에 관련된 특허를 추출할 수도 있습니다.
고급 찾다 옵션을 사용하면 생물학적 시퀀스 검색을 키워드 검색과 결합하여 귀중한 생물학적 시퀀스 정보를 잃지 않으면서도 노이즈를 줄일 수 있습니다.

무료 및 유료 데이터베이스의 차이점은 무엇인가?

생물학적 서열 특허 검색을 위한 무료 및 라이선스가 있는 데이터베이스가 있지만, 명심해야 할 몇 가지 차이점이 있습니다.

찾다
무료 데이터베이스는 생물학적 서열 특허에 대한 출처로 특정 웹사이트에 초점을 맞추는 경향이 있으므로, 적용 범위가 제한적이고 최신이 아닐 수도 있습니다.
유료 데이터베이스는 특허청에서 직접 정보를 수집하므로 더 광범위하고 정확한 특허 시퀀스 데이터를 제공합니다.
완성
무료 데이터베이스에서는 특허 정보로 결과를 필터링하는 옵션이 제한적이며, 많은 경우 특허에 대한 데이터가 거의 없습니다.
유료 데이터베이스에는 특허 전문가를 위해 특별히 개발된 고급 필터링 옵션이 포함되어 있으며, 여기에는 키워드와 전체 텍스트 검색을 결합하는 기능이 포함됩니다.
표시하다
무료 데이터베이스는 일반적으로 사용하기 쉽지 않고, 사용 가능한 시퀀스 매칭 정보가 제한적입니다.
유료 데이터베이스는 시퀀스 정렬을 더 간단하고 포괄적으로 표시하므로 스크리닝하기가 더 쉽습니다.
데이터 내보내기
무료 데이터베이스는 데이터 내보내기 기능을 제공하지 않으며 제한된 서식 옵션을 제공하지 않습니다.
유료 데이터베이스는 보고서를 사용자 정의하는 기능을 포함하여 다양한 형식의 데이터를 내보낼 수 있는 기능을 제공합니다.
지원하다
무료 데이터베이스는 사용료가 부과되지 않을 수도 있지만, 어떠한 지원도 제공하지 않습니다.
유료 데이터베이스는 추가적인 계층을 제공하거나 라이선스 비용의 일부를 지원하므로 공급업체에 질문하고, 검색을 개선하기 위한 지침을 받고, 심지어 불확실하거나 리소스가 부족한 경우 검색을 대신 수행해 달라고 요청할 수도 있습니다.

생물 시퀀스 특허 찾다 모범 사례

포괄적이고 정확하고 정밀한 생물학적 서열 특허 검색 결과를 얻으려면 특허 초안 작성과 특허 검색의 세부 사항을 모두 이해해야 합니다.

Orbit BioSequence 와 같은 전문 생물 시퀀스 특허 검색 도구를 사용하면 결과를 얻고 개선하는 데 필요한 데이터, 검색 매개변수 및 필터를 얻을 수 있습니다.

생물학적 시퀀스 데이터를 검색할 때 중요한 점은 완전한 검색 결과를 얻으려면 전체 특허를 고려하는 것입니다.

마지막으로, BioSequence 주제 전문가에게 선행 기술 검색을 아웃소싱하면 추가 지원을 받을 수 있습니다. 법률 의견을 내거나 침해에 대한 신청이나 방어를 제기하기 전에 필요한 양질의 검색 결과를 찾도록 하세요.

생물학적 시퀀스 특허 검색에 대해 자세히 알아보려면 ' 기존 선행 기술 검색을 넘어서' 라는 주문형 웨비나를 시청하고, Orbit Biosequence 데모를 요청하거나 , 해당 분야 전문가에게 문의하세요 .

저자 소개

Juliane Wissuwa

Questel에서 생명 과학 분야의 비즈니스 인텔리전스 컨설턴트로 일하고 있으며 응용 미생물학 박사 학위를 취득했습니다.